三輪神社(みわじんじゃ)は、「三輪」を社名に持つ神社。日本全国にある。
奈良県桜井市の三輪山を神体山とする三輪神社については大神神社を、同音異字の美和神社(みわじんじゃ)の一覧については美和神社を参照。本項では上記以外の三輪神社について列挙する。