リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ
| リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 5.1.3.1 | ||||||||
| CAS登録番号 | 9024-20-8 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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リブロース-5-リン酸-3-エピメラーゼ(Ribulose-phosphate 3-epimerase、EC 5.1.3.1)は、還元的ペントースリン酸回路において、D-リブロース-5-リン酸をD-キシルロース-5-リン酸に変換する酵素である。
- D-リブロース-5-リン酸 D-キシルロース-5-リン酸
従って、この酵素の基質はD-リブロース-5-リン酸の1つ、生成物はD-キシルロース-5-リン酸の1つである。
この酵素は異性化酵素、特に炭水化物及びその類縁体に作用するラセマーゼ、エピメラーゼに分類される。
金属耐性細菌Cupriavidus metalliduransは、この酵素をコードする2つの遺伝子を持っていることが知られている[1]。1つは染色体のP40117、もう1つはプラスミドのQ04539である。この酵素は、幅広い種類の細菌、古細菌、菌類、植物で見られる。全てのタンパク質は、209から241アミノ酸残基であり、TIMバレル構造を持つ。
この酵素の系統名は、D-リブロース-5-リン酸 3-エピメラーゼ(D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)である。PPEとも呼ばれる。
この酵素は、ペントースリン酸経路、ペントースとグルクロン酸の相互変換、炭酸固定の3つの代謝経路に関与している。
構造
[編集]2007年末時点で、4つの構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのコードは、1H1Y、1H1Z、1RPX、1TQJである。
脚注
[編集]- ^ Bowien B, Kusian B, Yoo JG, Bednarski R (1992). [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC207429/ “The Calvin cycle enzyme pentose-5-phosphate 3-epimeras e is encoded within the cfx operons of the chemoautotroph Alcaligenes eutrophus”]. J. Bacteriol. 174 (22): 7337–7344. PMC 207429. PMID 1429456.
出典
[編集]- Ashwell G and Hickman J (1957). “Enzymatic formation of xylulose 5-phosphate from ribose 5-phosphate in spleen”. J. Biol. Chem. 226 (1): 65–76. PMID 13428737.
- DICKENS F, WILLIAMSON DH (1956). “Pentose phosphate isomerase and epimerase from animal tissues”. Biochem. J. 64 (3): 567–78. PMC 1199776. PMID 13373810.
- Hurwitz J and Horecker BL (1956). “The purification of phosphoketopentoepimerase from Lactobacillus pentosus and the preparation of xylulose 5-phosphate”. J. Biol. Chem. 223 (2): 993–1008. PMID 13385247.
- Stumpf PK and Horecker BL (1956). “The roole of xylulose 5-phosphate in xylose metabolism of Lactobacillus pentosus”. J. Biol. Chem. 218: 753–768.
- Terada T, Mukae H, Ohashi K, Hosomi S, Mizoguchi T, Uehara K (1985). “Characterization of an enzyme which catalyzes isomerization and epimerization of D-erythrose 4-phosphate”. Eur. J. Biochem. 148 (2): 345–51. doi:10.1111/j.1432-1033.1985.tb08845.x. PMID 3987693.