ペルルシジバカ・アクアティカ
| ペルルシジバカ・アクアティカ | |||||||||||||||||||||
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| 分類 | |||||||||||||||||||||
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| 学名 | |||||||||||||||||||||
| Perlucidibaca aquatica Song et al. 2008[1] (IJSEMリストに掲載 2008)[2] | |||||||||||||||||||||
| タイプ株 | |||||||||||||||||||||
| BK296[3] JCM 31377[4] KCTC 52162[5] |
ペルルシジバカ・アクアティカ（Perlucidibaca aquatica）はPseudomonadota門ガンマプロテオバクテリア綱シュードモナス目モラクセラ科ペルルシジバカ属の種の一つであり、偏性好気性かつ非運動性のグラム陰性桿菌である。
概要
[編集]種名"aquatica"は、「水から発見された」を意味するラテン語形容詞である[6]。
グラム陰性、オキシダーゼ陽性、カタラーゼ陰性、非運動性、非滑走運動性、偏性好気性。細胞は桿状（0.5～0.7µm×1.0～1.6µm）である。コロニーはR2A寒天培地上で30℃5日間培養後では、直径0.5～1.0mm、円形、凸型、平滑、周縁が有り全体は白色透明である。生育条件は温度10～37℃（最適温度30℃）、pH 6.0～10.0（最適pH 7.0～8.0）、NaCl濃度は0～1.0% NaCl（最適濃度0%）である。硝酸塩還元、インドール生成、グルコース発酵、アルギニンジヒドロラーゼ、ウレアーゼ、ゼラチン液化、PNPG（β-ガラクトシダーゼ）については陰性であるが、エスクリン加水分解については陽性である。アルカリホスファターゼ、エステラーゼ(C4)及びエステラーゼリパーゼ(C8)、リパーゼ(C14)、ロイシンアリルアミダーゼ、バリンアリルアミダーゼ、酸性ホスファターゼ及びナフトール-AS-BI-ホスホヒドロラーゼの酵素活性を示す。一方で、シスチンアリルアミダーゼ、トリプシン、α-ガラクトシダーゼ、β-ガラクトシダーゼ、β-グルクロニダーゼ、α-グルコシダーゼ、β-グルコシダーゼ、N-アセチル-β-グルコサミニダーゼ、α-マンノシダーゼ及びα-フコシダーゼについては酵素活性を示さない。Biolog GN2 MicroPlateを用いた鑑別ではTween 40、Tween 80、ピルビン酸メチルエステル、セバシン酸、及びコハク酸の酸化試験では陽性を示す。イソプレノイドキノンとしてQ-8が検出される。主要な細胞脂肪酸は、summed feature 3（C16:1ω7c及び/又はC16:1ω6c）、C16:0、C12:0 3-OH、及びsummed feature 8（C18:1ω7c及び/又はC18:1ω6c）である。
タイプ株はBK296T（=KCTC 52162T、=JCM 31377T）である[6]であり、韓国三陟市の鍾乳洞Chodanggul Cave（37° 23′ 04″ N 129° 11′ 24″ E）の水から発見された。GC含量は55.7 mol%である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はKU984676である[7]。この株のドラフトゲノム配列のNCBIバイオプロジェクトのアクセッション番号はPRJNA322579である[8]。
脚注
[編集]- ^ Jaeho Song, Yoe-Jin Choo, Jang-Cheon Cho (01 January 2008). “Perlucidibaca piscinae gen. nov., sp. nov., a freshwater bacterium belonging to the family Moraxellaceae”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58 (1): 97-102. doi:10.1099/ijs.0.65039-0. PMID 18175691.
- ^ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 58, part 1, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58 (4): 747-748. (01 April 2008). doi:10.1099/ijs.0.2008/001446-0.
- ^ “Perlucidibaca aquatica BK296 is an aerobe, Gram-negative, rod-shaped bacterium that forms circular colonies and was isolated from Sohancheon limestone stream originated from Chodanggul Cave, Gangwon province, Korea.”. The Bacterial Diversity Metadatabase (BacDive). 2024年9月13日閲覧。
- ^ “Perlucidibaca aquatica Baek et al. 2017”. 微生物材料開発室 (JCM) (RIKEN BRC) - 理化学研究所. 2021年9月9日閲覧。
- ^ “KCTC 52162 Perlucidibaca aquatica”. Korean Collection for Type Cultures (KCTC). 2021年9月9日閲覧。
- ^ a b Kiwoon Baek, Ji-Hye Han, Mi-Hwa Lee (01 July 2017). “Perlucidibaca aquatica sp. nov., isolated from fresh water”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (7): 2296-2300. doi:10.1099/ijsem.0.001940. PMID 28741994.
- ^ “Perlucidibaca aquatica strain BK296 16S ribosomal RNA gene, partial sequence”. アメリカ国立生物工学情報センター (NCBI). 2024年9月13日閲覧。
- ^ “Perlucidibaca aquatica strain:BK296 Genome sequencing and assembly”. アメリカ国立生物工学情報センター (NCBI). 2024年9月13日閲覧。