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BCR (タンパク質)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』
（BCR (遺伝子)から転送）
BCR
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1K1F, 2AIN

識別子
記号BCR, Bcr, 5133400C09Rik, AI561783, AI853148, mKIAA3017, ALL, BCR1, CML, D22S11, D22S662, PHL, RhoGEF and GTPase activating protein, BCR gene, BCR activator of RhoGEF and GTPase
外部IDOMIM: 151410 MGI: 88141 HomoloGene: 3192 GeneCards: BCR
遺伝子の位置 (ヒト)
22番染色体 (ヒト)
染色体22番染色体 (ヒト)[1]
22番染色体 (ヒト)
BCR遺伝子の位置
BCR遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点23,179,704 bp[1]
終点23,318,037 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
10番染色体 (マウス)
染色体10番染色体 (マウス)[2]
10番染色体 (マウス)
BCR遺伝子の位置
BCR遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点74,896,424 bp[2]
終点75,020,753 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能• トランスフェラーゼ活性
• ヌクレオチド結合
• guanyl-nucleotide exchange factor activity
• キナーゼ活性
• protein serine/threonine kinase activity
• 血漿タンパク結合
• 酵素結合
• protein tyrosine kinase activity
• ATP binding
• GTPase activator activity
細胞の構成要素• 細胞質
• 細胞質基質
• postsynaptic membrane
• 膜
• シナプス後肥厚
• 細胞膜
• シナプス
• 細胞結合
• エキソソーム
• 高分子複合体
• Schaffer collateral - CA1 synapse
• glutamatergic synapse
• postsynaptic density, intracellular component
• 細胞内
生物学的プロセス• positive regulation of phagocytosis
• intracellular signal transduction
• neuromuscular process controlling balance
• リン酸化
• regulation of cell cycle
• negative regulation of blood vessel remodeling
• タンパク質リン酸化
• negative regulation of cellular extravasation
• リポ多糖への反応
• 脳発生
• regulation of vascular permeability
• negative regulation of cell migration
• negative regulation of neutrophil degranulation
• inner ear morphogenesis
• 自己リン酸化
• platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
• regulation of Rho protein signal transduction
• regulation of small GTPase mediated signal transduction
• negative regulation of inflammatory response
• actin cytoskeleton organization
• シグナル伝達
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• renal system process
• homeostasis of number of cells
• regulation of nitrogen compound metabolic process
• definitive hemopoiesis
• negative regulation of respiratory burst
• intracellular protein transmembrane transport
• cellular response to lipopolysaccharide
• negative regulation of reactive oxygen species metabolic process
• positive regulation of GTPase activity
• シナプス伝達の制御
• small GTPase mediated signal transduction
• keratinocyte differentiation
• focal adhesion assembly
• activation of GTPase activity
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

613

110279

Ensembl

ENSG00000186716

ENSMUSG00000009681

UniProt

P11274,H0Y554

Q6PAJ1

RefSeq
(mRNA)

NM_004327
NM_021574

NM_001081412

RefSeq
(タンパク質)

NP_004318
NP_067585

NP_001074881

場所
(UCSC)		Chr 22: 23.18 – 23.32 MbChr 22: 74.9 – 75.02 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
Bcr-Abl oncoprotein oligomerisation domain
Bcr-Ablがんタンパク質のオリゴマー化ドメインの構造
識別子
略号 Bcr-Abl_Oligo
Pfam PF09036
InterPro IPR015123
利用可能な蛋白質構造:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum structure summary
テンプレートを表示

BCR（breakpoint cluster region protein）は、ヒトではBCR遺伝子によってコードされているタンパク質である。BCR遺伝子は、フィラデルフィア染色体と関係したBCR-ABL融合遺伝子を構成する2つの遺伝子のうちの一方である。BCR遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2種類の転写バリアントが見つかっている。

機能

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BCR-ABL融合タンパク質に関しては多くの研究がなされている一方で、正常なBCR遺伝子産物の機能はいまだ明確ではない。BCRタンパク質はセリン/スレオニンキナーゼ活性を持ち[5]、またRhoA（英語版）に対するグアニンヌクレオチド交換因子[6]、Rac（英語版）に対するGTPアーゼ活性化タンパク質として機能する[7]。

臨床的意義

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22番染色体と9番染色体（英語版）との間の相互転座によって形成されるフィラデルフィア染色体は、慢性骨髄性白血病の患者にみられることが多い。この転座における22番染色体上の切断点はBCR遺伝子内に位置している。この転座によって、BCR遺伝子と9番染色体上の切断点に位置するABL遺伝子の双方に由来する配列からBCR-ABL融合タンパク質が産生されるようになる[5]。

構造

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染色体転座によるBCR-ABL融合遺伝子形成の模式図

BCR-ABLがんタンパク質のオリゴマー化ドメインはBCRのN末端に位置し、この融合タンパク質の発がん性に必要不可欠である。オリゴマー化ドメインはN末端の短いヘリックス（α1）、柔軟なループ、そしてC末端の長いヘリックス（α2）から構成される。これらはN字型構造を形成し、2つのヘリックスは平行な向きに並ぶ。2つの単量体ドメインは、α2ヘリックスの間での逆平行コイルドコイルの形成、そしてα1ヘリックス間のドメインスワッピングによって一方のα1ヘリックスがもう一方のα2ヘリックスに対してパッキングすることで二量体を形成する。その後、2つの二量体が四量体へと結合する[8]。BCR-ABLがんタンパク質の逆平行コールドコイルドメイン（BCR30-65）を開始構造とした構造ベースの改変によって、pH感受性のホモ二量体逆平行コイルドコイルが作出されている[9]。

相互作用

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BCRは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186716 - Ensembl, May 2017
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  8. ^ Zhao X, Ghaffari S, Lodish H, Malashkevich VN, Kim PS (February 2002). "Structure of the Bcr-Abl oncoprotein oligomerization domain". Nature Structural Biology. 9 (2): 117–120. doi:10.1038/nsb747. PMID 11780146. S2CID 17453012。
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関連文献

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関連項目

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外部リンク

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